Het bestuur van de Stichting voor Openbaar Voortgezet Onderwijs Noord- en Midden-Drenthe vormt het bevoegd gezag van het Dr. Nassau College.
Het toezicht op het bestuur wordt uitgeoefend door de Raad van Toezicht (RvT) De RvT houdt integraal toezicht op alle aspecten van de Stichting en de onderwijsorganisatie. De Raad richt zich daarbij naar het belang van de Stichting, het belang van de scholen die door de Stichting in stand worden gehouden en het belang van de samenleving. De RvT let daarbij in het bijzonder op de wijze waarop inhoud wordt gegeven aan de openbare identiteit, zoals bedoeld in artikel 42 van de Wet op het voortgezet onderwijs. De RvT toetst de afwegingen die het bestuur heeft gemaakt en of deze daarbij alle relevante belangen heeft meegenomen.
De heer M.M.A.M. Klaverkamp is de directeur-bestuurder (in naam voorzitter College van Bestuur) van de Stichting en vormt het bevoegd gezag. De voorzitter van het College van Bestuur (CvB) heeft op grond van de Statuten de positie van bevoegd gezag van het Dr. Nassau College. Voor een aantal besluiten, begroting/jaarrekening, heeft de voorzitter van het CvB de goedkeuring van de Raad van Toezicht nodig.
De dagelijkse leiding op de verschillende locaties is in handen van de locatiedirecteuren. Tezamen vormen zij het Centraal Managementteam. Het Centraal Managementteam legt de genomen adviezen ter besluitvorming voor aan de voorzitter van het CvB. De voorzitter van het Centraal Managementteam is de heer M.M.A.M. Klaverkamp, voorzitter CvB.
De centrale afdelingen van het Dr. Nassau College zijn gevestigd in het bedrijfsbureau. De afdelingshoofden staan onder leiding van de heer Klaverkamp.